Disporre i tre tubi di deriva in modo che depongono paralleli tra loro e perpendicolari al percorso del fascio di elettroni Altre istruzioni
. Attaccare gli elettrodi ad alta tensione a ciascuna delle camere a deriva .
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Collocare le due bobine di Helmholtz tra l'EBIT ed i tubi di deriva su entrambi i lati della canna . Accendere le bobine prima di attivare l'EBIT . Determinare la tensione che si desidera inviare attraverso gli elettrodi nel tubo deriva . Questo stabilirà il livello di energia per l' EBIT . Impostare il livello del risultato operativo.
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Attivare il risultato operativo , l'invio del fascio di elettroni attraverso i tubi di deriva . Il fascio di elettroni inizierà con una larghezza di circa 1 mm , ma lo scopo dei magneti è quello di ridurre questo diametro di circa 100 micrometri . Il fascio di elettroni viene attrarre e intrappolare gli ioni caricati positivamente che entrano nel sistema attraverso gli elettrodi ad alta tensione .