Esaminare il contenuto di GC (numero di G e C di ) nella sequenza primer. GC legame è più forte di AT incollaggio a causa del legame idrogeno aggiuntivo tra la guanina e citosina . Incollaggio ottimale è di almeno il 50 per cento contenuto di GC .
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Esaminare la temperatura di ricottura della tua reazione . Temperature di ricottura basse , generalmente definiti come 55 C o inferiori , possono causare un legame non specifico del primer , che può causare dimeri di primer , oltre all'amplificazione di sezioni genomiche errati .
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Doppia -controllare la quantità e la concentrazione dei primer aggiunto al PCR . Un eccesso di primer , in genere più di 75 picomoli , può causare dimeri di primer , pure.